学院研究生主要通过双选会面向全国民航各相关单位就业。例如:航空公司、机场中的飞行签派、飞行性能分析、142训练中心地面教员、机坪管制、飞行技术与管理、飞行运行控制、航务管理、飞行程序设计等;航空制造业中的培训与客户支持;各高校/培训机构中民航相关专业教师岗位、民航行政部门和事业单位中的民航安全管理、技术研究等。另外,还有部分毕业生进入其他院校进行博士深造学习。多年来就业率保持在95%以上。以下为近五年飞行技术学院全部研究生毕业去向以及具体人数。